225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2687 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 192 aa  97.8  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  35.96 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  39.45 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.19 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 367 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  43.28 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  43.28 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  43.28 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  43.28 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  43.28 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  43.28 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  43.28 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  34.48 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  41.79 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  41.79 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  41.79 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  41.79 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  41.79 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  41.79 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  41.79 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  47.37 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  41.79 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  41.54 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  34.21 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  41.79 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  37.27 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  40 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  36.29 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  31.18 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  40.3 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  27.03 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  36.67 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  37.31 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  30.11 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  31.65 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  28.7 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  37.31 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>