More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2708 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  100 
 
 
194 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  91.71 
 
 
201 aa  357  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  91.19 
 
 
198 aa  355  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  57.37 
 
 
202 aa  219  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  59.16 
 
 
211 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  58.56 
 
 
208 aa  207  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  51.58 
 
 
194 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1151  transcriptional regulator TetR family  57.56 
 
 
182 aa  185  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  51.58 
 
 
194 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  54.69 
 
 
190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  52.15 
 
 
189 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  49.47 
 
 
194 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 
202 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  40.72 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  39.57 
 
 
202 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  39.57 
 
 
202 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  39.57 
 
 
195 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  39.57 
 
 
195 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  39.57 
 
 
195 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  39.57 
 
 
195 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  39.57 
 
 
202 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  42.05 
 
 
196 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  38.14 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  37.63 
 
 
194 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  37.63 
 
 
194 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  37.63 
 
 
194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 
198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
195 aa  138  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  39.58 
 
 
195 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  37.7 
 
 
195 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  36.6 
 
 
194 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  36.6 
 
 
194 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  36.6 
 
 
194 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  41.05 
 
 
197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  38.86 
 
 
197 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  37.24 
 
 
196 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  38.54 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  38.54 
 
 
197 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  36.68 
 
 
218 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 
218 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  38.74 
 
 
195 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 
218 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  38.97 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  40 
 
 
201 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  40 
 
 
201 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  39.29 
 
 
196 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  39.41 
 
 
201 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  39.41 
 
 
201 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  38.54 
 
 
197 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 
196 aa  121  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  38.54 
 
 
197 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  37.79 
 
 
197 aa  121  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  37.93 
 
 
201 aa  120  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  39.08 
 
 
201 aa  121  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  36.41 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  37.06 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  35.9 
 
 
195 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 
199 aa  118  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  35.9 
 
 
195 aa  118  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  35.9 
 
 
195 aa  118  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  34.02 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  35.9 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  36.41 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  35.9 
 
 
195 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  35.9 
 
 
195 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  35.76 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  36.26 
 
 
180 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  37.57 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  35.76 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  33.16 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  36.26 
 
 
202 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
196 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 
677 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
201 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
197 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
221 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
213 aa  58.2  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 
215 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 
308 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
215 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  39.24 
 
 
225 aa  55.1  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 
367 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  40.26 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
214 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
215 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>