179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2182 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  89.01 
 
 		 194 aa  321  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  62.9 
 
 		 189 aa  222  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  56.54 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  51.58 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  50.52 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  50 
 
 		 198 aa  187  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  50.26 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  49.19 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  49.47 
 
 		 211 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1151  transcriptional regulator TetR family  46.55 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  41.49 
 
 		 195 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  40.53 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  40.53 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  40.53 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  40.96 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  40.96 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  40.96 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  40.96 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  40.96 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  40.96 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  40.96 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  39.36 
 
 		 194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  39.89 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  37.82 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  38.83 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  38.83 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  38.42 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  36.98 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  37.24 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  35.23 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  36.98 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  36.08 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  36.73 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  36.73 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  36.73 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  34.9 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  36.73 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  36.73 
 
 		 195 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  34.9 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  39.36 
 
 		 195 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  36.73 
 
 		 195 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  35.57 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  37.63 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  35.05 
 
 		 218 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  35.05 
 
 		 218 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  33.68 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  34.85 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  38.3 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  34.85 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  34.85 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  34.36 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  34.34 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  37.57 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  36.98 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  36.98 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  34.76 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  34.62 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  34.52 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  34.02 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 201 aa  98.2  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  33.51 
 
 		 198 aa  98.2  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  32.47 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  32.82 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  31.61 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  33.14 
 
 		 180 aa  92  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 677 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  27.44 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 308 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 213 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>