More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0891 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 208 aa  413  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  90.87 
 
 		 211 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  79.08 
 
 		 202 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1151  transcriptional regulator TetR family  73.26 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  58.56 
 
 		 194 aa  207  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  55.5 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  54.97 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  47.89 
 
 		 194 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  49.19 
 
 		 194 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  49.19 
 
 		 194 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  48.94 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  38.95 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  37.77 
 
 		 194 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  38.3 
 
 		 194 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  38.3 
 
 		 194 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  38.3 
 
 		 194 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  37.77 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  37.77 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  37.77 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  37.97 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  37.97 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  37.97 
 
 		 202 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  37.97 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  37.97 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  37.97 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  37.97 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  37.43 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  36.46 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  38.3 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  36.13 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  34.24 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  35.6 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  36.07 
 
 		 195 aa  111  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  35.6 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  37.77 
 
 		 195 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  34.39 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  35.12 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  34.39 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  34.39 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  34.92 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  34.95 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  34.39 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  34.92 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  34.39 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 677 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  34.57 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  34.74 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  34.39 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  34.52 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  33.86 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  36.31 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  33.86 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  33.85 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  33.93 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  33.85 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  33.93 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  33.93 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  34.91 
 
 		 198 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  35.71 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  34.52 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  33.53 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  33.14 
 
 		 186 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  34.1 
 
 		 180 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  31.61 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  35.94 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  35.94 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  32.11 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  34.76 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  30.41 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>