164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2915 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  99.44 
 
 		 198 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  77.14 
 
 		 195 aa  286  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  74.71 
 
 		 198 aa  269  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  62.86 
 
 		 196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  62.64 
 
 		 195 aa  224  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  62.64 
 
 		 195 aa  224  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  59.77 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  62.07 
 
 		 195 aa  221  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  62.07 
 
 		 195 aa  221  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  60.92 
 
 		 197 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  62.07 
 
 		 195 aa  220  9e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  62.07 
 
 		 195 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  62.07 
 
 		 195 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  62.07 
 
 		 195 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  59.2 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  59.2 
 
 		 197 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  59.2 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  59.2 
 
 		 197 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  63.79 
 
 		 197 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  63.79 
 
 		 197 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  55.62 
 
 		 194 aa  205  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  55.17 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  55.23 
 
 		 202 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  55.23 
 
 		 202 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  55.23 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  55.23 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  55.23 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  55.23 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  54.44 
 
 		 194 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  54.44 
 
 		 194 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  54.65 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  53.25 
 
 		 194 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  53.25 
 
 		 194 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  53.25 
 
 		 194 aa  198  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  53.85 
 
 		 194 aa  197  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  55.62 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  54.17 
 
 		 196 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  55.23 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  52.63 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  52.07 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  47.22 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  48.57 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  50 
 
 		 197 aa  150  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  45.2 
 
 		 201 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  44.83 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  45.2 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  45.2 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  47.71 
 
 		 201 aa  144  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  45.2 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  47.34 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  47.37 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  47.71 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  44.58 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  48.3 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  47.71 
 
 		 201 aa  134  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  47.71 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  46.1 
 
 		 201 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 677 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  36.26 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  34.3 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  34.3 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  36.13 
 
 		 189 aa  97.8  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  34.1 
 
 		 208 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  36.24 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  36.24 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  29.48 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1151  transcriptional regulator TetR family  30.86 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  34.68 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  32.89 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 214 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 367 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  22.42 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 308 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  26.06 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>