More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8404 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 677 aa  1328    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  32.21 
 
 		 485 aa  225  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  31.13 
 
 		 494 aa  198  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  28.95 
 
 		 486 aa  197  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06180  betaine aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 		 486 aa  193  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0327  betaine aldehyde dehydrogenase  30.24 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  30.53 
 
 		 490 aa  191  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  30.62 
 
 		 490 aa  190  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  30.62 
 
 		 490 aa  190  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0374  betaine aldehyde dehydrogenase  30.24 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1514  betaine aldehyde dehydrogenase  29.52 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0736273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  30.38 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.934353 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3294  betaine aldehyde dehydrogenase  30 
 
 		 490 aa  188  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0371  betaine aldehyde dehydrogenase  30.24 
 
 		 490 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3311  betaine aldehyde dehydrogenase  30 
 
 		 490 aa  188  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  30.55 
 
 		 489 aa  187  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00268  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  30 
 
 		 490 aa  187  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00271  hypothetical protein  30 
 
 		 490 aa  187  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.802759  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0343  betaine aldehyde dehydrogenase  30.24 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8400  betaine aldehyde dehydrogenase  31.68 
 
 		 489 aa  184  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 		 490 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3537  betaine aldehyde dehydrogenase  29.83 
 
 		 489 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1833  betaine aldehyde dehydrogenase  29.72 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  28.21 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0554  betaine aldehyde dehydrogenase  30.55 
 
 		 489 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3269  betaine aldehyde dehydrogenase  30.31 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5099  betaine aldehyde dehydrogenase  30.31 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  28.33 
 
 		 490 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0402  betaine aldehyde dehydrogenase  28.33 
 
 		 490 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  28.33 
 
 		 490 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3841  betaine aldehyde dehydrogenase  28.88 
 
 		 489 aa  178  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5183  betaine aldehyde dehydrogenase  30.07 
 
 		 489 aa  178  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  30.31 
 
 		 489 aa  177  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  28.77 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  30.07 
 
 		 489 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2588  betaine aldehyde dehydrogenase  27.51 
 
 		 491 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1924  betaine aldehyde dehydrogenase  30.31 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00178825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0180  betaine aldehyde dehydrogenase  30.31 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  30.28 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0915  betaine aldehyde dehydrogenase  30.31 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101083  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0467  betaine aldehyde dehydrogenase  30.31 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1073  betaine aldehyde dehydrogenase  29.59 
 
 		 492 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000506243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1427  betaine aldehyde dehydrogenase  30.31 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1008  betaine aldehyde dehydrogenase  27.34 
 
 		 487 aa  171  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0376  betaine aldehyde dehydrogenase  30.07 
 
 		 489 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1836  betaine aldehyde dehydrogenase  30.07 
 
 		 489 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  28.98 
 
 		 489 aa  170  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4733  betaine aldehyde dehydrogenase  28.64 
 
 		 490 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2071  betaine aldehyde dehydrogenase  27.57 
 
 		 488 aa  169  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  28.19 
 
 		 488 aa  168  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02641  betaine aldehyde dehydrogenase  26.9 
 
 		 488 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0441  betaine aldehyde dehydrogenase BADH  28.4 
 
 		 490 aa  167  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  31.61 
 
 		 483 aa  167  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1324  betaine aldehyde dehydrogenase  28.16 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4011  betaine aldehyde dehydrogenase  27.21 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0714  betaine aldehyde dehydrogenase  27.82 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0388139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1197  betaine aldehyde dehydrogenase  26.77 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1120  betaine aldehyde dehydrogenase  27.34 
 
 		 487 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0729  betaine aldehyde dehydrogenase  27.78 
 
 		 500 aa  165  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3036  betaine aldehyde dehydrogenase  28.16 
 
 		 487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0986408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  27.38 
 
 		 487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0777  betaine aldehyde dehydrogenase  29.05 
 
 		 487 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549042  normal  0.0734216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0873  betaine aldehyde dehydrogenase  27.68 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1350  betaine aldehyde dehydrogenase  27.95 
 
 		 487 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1947  betaine aldehyde dehydrogenase  27.15 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.614027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1314  betaine aldehyde dehydrogenase  27.92 
 
 		 487 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4370  betaine aldehyde dehydrogenase  32.59 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0990  betaine aldehyde dehydrogenase  31.9 
 
 		 487 aa  160  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1333  betaine aldehyde dehydrogenase  26.25 
 
 		 487 aa  160  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0890  betaine aldehyde dehydrogenase  27.62 
 
 		 487 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187132  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2710  betaine aldehyde dehydrogenase  29.23 
 
 		 487 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2183  betaine aldehyde dehydrogenase  32.14 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0855  betaine aldehyde dehydrogenase  32.14 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0553  betaine aldehyde dehydrogenase  28.86 
 
 		 487 aa  154  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0552  betaine aldehyde dehydrogenase  28.64 
 
 		 487 aa  152  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.08 
 
 		 488 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  29.27 
 
 		 488 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  29.1 
 
 		 488 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  28.15 
 
 		 497 aa  147  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  29.4 
 
 		 488 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.4 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  28.8 
 
 		 492 aa  145  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  28.8 
 
 		 488 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  28.38 
 
 		 488 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  26.53 
 
 		 495 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  30 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  28.7 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  26.35 
 
 		 485 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  26.17 
 
 		 506 aa  140  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1493  betaine aldehyde dehydrogenase  26.92 
 
 		 481 aa  140  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330699  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04229  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  25.9 
 
 		 488 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04195  hypothetical protein  25.9 
 
 		 488 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01430  betaine aldehyde dehydrogenase (BadH), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04080)  23.75 
 
 		 497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0771988  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  25.98 
 
 		 490 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1177  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  25.48 
 
 		 488 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.585771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0627  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  27.1 
 
 		 484 aa  137  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  30.64 
 
 		 495 aa  137  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4889  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  25.69 
 
 		 488 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1166  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  25.27 
 
 		 488 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  0.856893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>