More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2555 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0371  betaine aldehyde dehydrogenase  78.16 
 
 		 490 aa  782    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00268  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  78.16 
 
 		 490 aa  781    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1514  betaine aldehyde dehydrogenase  82.04 
 
 		 490 aa  822    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0736273  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3294  betaine aldehyde dehydrogenase  77.96 
 
 		 490 aa  780    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0467  betaine aldehyde dehydrogenase  72.04 
 
 		 489 aa  710    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  75.92 
 
 		 490 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00271  hypothetical protein  78.16 
 
 		 490 aa  781    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.802759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0374  betaine aldehyde dehydrogenase  77.96 
 
 		 490 aa  776    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  75.92 
 
 		 490 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0441  betaine aldehyde dehydrogenase BADH  75.92 
 
 		 490 aa  758    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558402  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1833  betaine aldehyde dehydrogenase  73.06 
 
 		 490 aa  730    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  75.71 
 
 		 490 aa  761    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  84.49 
 
 		 490 aa  866    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0915  betaine aldehyde dehydrogenase  72.04 
 
 		 489 aa  710    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0402  betaine aldehyde dehydrogenase  76.33 
 
 		 490 aa  761    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  71.22 
 
 		 489 aa  727    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4733  betaine aldehyde dehydrogenase  76.53 
 
 		 490 aa  763    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0729  betaine aldehyde dehydrogenase  72.37 
 
 		 500 aa  701    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  72.45 
 
 		 489 aa  743    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0376  betaine aldehyde dehydrogenase  72.04 
 
 		 489 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  76.12 
 
 		 490 aa  789    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3537  betaine aldehyde dehydrogenase  72.86 
 
 		 489 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1924  betaine aldehyde dehydrogenase  71.84 
 
 		 489 aa  708    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00178825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  77.14 
 
 		 490 aa  773    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3311  betaine aldehyde dehydrogenase  77.96 
 
 		 490 aa  780    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0554  betaine aldehyde dehydrogenase  73.27 
 
 		 489 aa  720    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  73.27 
 
 		 489 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1073  betaine aldehyde dehydrogenase  72.45 
 
 		 492 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000506243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1427  betaine aldehyde dehydrogenase  72.04 
 
 		 489 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  84.29 
 
 		 490 aa  841    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  76.33 
 
 		 490 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5183  betaine aldehyde dehydrogenase  73.27 
 
 		 489 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5099  betaine aldehyde dehydrogenase  73.27 
 
 		 489 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  70.61 
 
 		 489 aa  726    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8400  betaine aldehyde dehydrogenase  68.25 
 
 		 489 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  68.28 
 
 		 494 aa  707    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0873  betaine aldehyde dehydrogenase  73.72 
 
 		 504 aa  704    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1836  betaine aldehyde dehydrogenase  72.04 
 
 		 489 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 490 aa  1006    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3269  betaine aldehyde dehydrogenase  73.27 
 
 		 489 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0327  betaine aldehyde dehydrogenase  77.76 
 
 		 490 aa  775    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  73.67 
 
 		 489 aa  750    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0343  betaine aldehyde dehydrogenase  77.76 
 
 		 490 aa  778    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0180  betaine aldehyde dehydrogenase  72.04 
 
 		 489 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  79.18 
 
 		 490 aa  815    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  61.44 
 
 		 486 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06180  betaine aldehyde dehydrogenase  60.62 
 
 		 486 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  59.92 
 
 		 485 aa  591  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0714  betaine aldehyde dehydrogenase  59.75 
 
 		 487 aa  586  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0388139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1008  betaine aldehyde dehydrogenase  59.54 
 
 		 487 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1120  betaine aldehyde dehydrogenase  59.59 
 
 		 487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1333  betaine aldehyde dehydrogenase  58.3 
 
 		 487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4011  betaine aldehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 487 aa  574  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1197  betaine aldehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3036  betaine aldehyde dehydrogenase  59.05 
 
 		 487 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0986408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1314  betaine aldehyde dehydrogenase  59.05 
 
 		 487 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3841  betaine aldehyde dehydrogenase  58.88 
 
 		 489 aa  569  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1324  betaine aldehyde dehydrogenase  59.05 
 
 		 487 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1350  betaine aldehyde dehydrogenase  58.44 
 
 		 487 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1947  betaine aldehyde dehydrogenase  57.64 
 
 		 488 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.614027  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2071  betaine aldehyde dehydrogenase  57.03 
 
 		 488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02641  betaine aldehyde dehydrogenase  58.06 
 
 		 488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2588  betaine aldehyde dehydrogenase  58.06 
 
 		 491 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  55.39 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  55.3 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01430  betaine aldehyde dehydrogenase (BadH), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04080)  54.66 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0771988  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2710  betaine aldehyde dehydrogenase  56.34 
 
 		 487 aa  522  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0777  betaine aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 		 487 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549042  normal  0.0734216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0890  betaine aldehyde dehydrogenase  55.46 
 
 		 487 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187132  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_004310  BR0552  betaine aldehyde dehydrogenase  55.72 
 
 		 487 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183899  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  54.11 
 
 		 483 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0553  betaine aldehyde dehydrogenase  55.93 
 
 		 487 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4370  betaine aldehyde dehydrogenase  57.54 
 
 		 486 aa  506  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  52.7 
 
 		 487 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0855  betaine aldehyde dehydrogenase  54.11 
 
 		 483 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2183  betaine aldehyde dehydrogenase  53.47 
 
 		 483 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1493  betaine aldehyde dehydrogenase  50.94 
 
 		 481 aa  478  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1897  betaine aldehyde dehydrogenase  55.46 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0990  betaine aldehyde dehydrogenase  53.64 
 
 		 487 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  45.74 
 
 		 497 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.89 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.87 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.87 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 		 483 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  43.84 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  43.6 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  41.91 
 
 		 488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  41.7 
 
 		 488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.66 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  43.92 
 
 		 490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.51 
 
 		 483 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  42.86 
 
 		 490 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>