More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0563 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0552  betaine aldehyde dehydrogenase  68.44 
 
 		 487 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183899  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2183  betaine aldehyde dehydrogenase  70.02 
 
 		 483 aa  684    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2710  betaine aldehyde dehydrogenase  67.21 
 
 		 487 aa  659    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0777  betaine aldehyde dehydrogenase  86.86 
 
 		 487 aa  876    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549042  normal  0.0734216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1493  betaine aldehyde dehydrogenase  69.21 
 
 		 481 aa  679    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  85.42 
 
 		 488 aa  874    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 487 aa  995    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0890  betaine aldehyde dehydrogenase  86.86 
 
 		 487 aa  876    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187132  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  69.48 
 
 		 485 aa  689    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  70.64 
 
 		 483 aa  706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0855  betaine aldehyde dehydrogenase  70.43 
 
 		 483 aa  688    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0553  betaine aldehyde dehydrogenase  68.65 
 
 		 487 aa  667    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1897  betaine aldehyde dehydrogenase  64.95 
 
 		 481 aa  585  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4011  betaine aldehyde dehydrogenase  55.58 
 
 		 487 aa  564  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0714  betaine aldehyde dehydrogenase  55.46 
 
 		 487 aa  558  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0388139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3036  betaine aldehyde dehydrogenase  56.02 
 
 		 487 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0986408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1324  betaine aldehyde dehydrogenase  56.02 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  54.77 
 
 		 485 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1008  betaine aldehyde dehydrogenase  55.49 
 
 		 487 aa  548  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1314  betaine aldehyde dehydrogenase  55.6 
 
 		 487 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1350  betaine aldehyde dehydrogenase  55.81 
 
 		 487 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1947  betaine aldehyde dehydrogenase  55.81 
 
 		 488 aa  548  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.614027  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  56.63 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1333  betaine aldehyde dehydrogenase  55.39 
 
 		 487 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1120  betaine aldehyde dehydrogenase  54.98 
 
 		 487 aa  548  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2071  betaine aldehyde dehydrogenase  54.45 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1197  betaine aldehyde dehydrogenase  54.36 
 
 		 487 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  56.69 
 
 		 489 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  56.21 
 
 		 489 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02641  betaine aldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  56.07 
 
 		 489 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2588  betaine aldehyde dehydrogenase  53.61 
 
 		 491 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3841  betaine aldehyde dehydrogenase  53.2 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0554  betaine aldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  55.88 
 
 		 490 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3537  betaine aldehyde dehydrogenase  57.26 
 
 		 489 aa  534  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  53.11 
 
 		 486 aa  531  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5099  betaine aldehyde dehydrogenase  56.63 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  54.12 
 
 		 494 aa  529  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3269  betaine aldehyde dehydrogenase  56.63 
 
 		 489 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  54.95 
 
 		 489 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5183  betaine aldehyde dehydrogenase  56.21 
 
 		 489 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1073  betaine aldehyde dehydrogenase  56.84 
 
 		 492 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000506243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4370  betaine aldehyde dehydrogenase  57.08 
 
 		 486 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0376  betaine aldehyde dehydrogenase  56 
 
 		 489 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1836  betaine aldehyde dehydrogenase  56 
 
 		 489 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1924  betaine aldehyde dehydrogenase  56 
 
 		 489 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00178825  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0915  betaine aldehyde dehydrogenase  56 
 
 		 489 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101083  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1427  betaine aldehyde dehydrogenase  56 
 
 		 489 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0467  betaine aldehyde dehydrogenase  56 
 
 		 489 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0180  betaine aldehyde dehydrogenase  56 
 
 		 489 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06180  betaine aldehyde dehydrogenase  52.07 
 
 		 486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  52.9 
 
 		 490 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  53.57 
 
 		 490 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  53.57 
 
 		 490 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  54.41 
 
 		 490 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  53.53 
 
 		 490 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  52.7 
 
 		 490 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0402  betaine aldehyde dehydrogenase  54.2 
 
 		 490 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  53.99 
 
 		 490 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  53.99 
 
 		 490 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1833  betaine aldehyde dehydrogenase  53.61 
 
 		 490 aa  495  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1514  betaine aldehyde dehydrogenase  54.62 
 
 		 490 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0736273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0990  betaine aldehyde dehydrogenase  57 
 
 		 487 aa  488  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760814  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0873  betaine aldehyde dehydrogenase  53.94 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00268  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  53.11 
 
 		 490 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3294  betaine aldehyde dehydrogenase  52.9 
 
 		 490 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0441  betaine aldehyde dehydrogenase BADH  53.57 
 
 		 490 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558402  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0371  betaine aldehyde dehydrogenase  52.9 
 
 		 490 aa  485  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4733  betaine aldehyde dehydrogenase  53.57 
 
 		 490 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0729  betaine aldehyde dehydrogenase  52.35 
 
 		 500 aa  488  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0327  betaine aldehyde dehydrogenase  53.11 
 
 		 490 aa  488  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3311  betaine aldehyde dehydrogenase  52.9 
 
 		 490 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00271  hypothetical protein  53.11 
 
 		 490 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.802759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0374  betaine aldehyde dehydrogenase  52.9 
 
 		 490 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  52.73 
 
 		 490 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0343  betaine aldehyde dehydrogenase  53.11 
 
 		 490 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8400  betaine aldehyde dehydrogenase  54.03 
 
 		 489 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01430  betaine aldehyde dehydrogenase (BadH), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04080)  48.64 
 
 		 497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0771988  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  45.68 
 
 		 497 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  44.63 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.26 
 
 		 494 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.94 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.63 
 
 		 494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  44.63 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.63 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  44.75 
 
 		 490 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.54 
 
 		 490 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 		 494 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  44 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  43.28 
 
 		 490 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  44.51 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 		 494 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  42.53 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>