More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2588 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  64.45 
 
 		 486 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1197  betaine aldehyde dehydrogenase  71.84 
 
 		 487 aa  733    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1333  betaine aldehyde dehydrogenase  73.03 
 
 		 487 aa  744    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4011  betaine aldehyde dehydrogenase  71.58 
 
 		 487 aa  732    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02641  betaine aldehyde dehydrogenase  82.17 
 
 		 488 aa  846    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1324  betaine aldehyde dehydrogenase  73.31 
 
 		 487 aa  755    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1314  betaine aldehyde dehydrogenase  72.69 
 
 		 487 aa  749    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  67.84 
 
 		 485 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1008  betaine aldehyde dehydrogenase  72.67 
 
 		 487 aa  742    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1350  betaine aldehyde dehydrogenase  72.9 
 
 		 487 aa  749    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0714  betaine aldehyde dehydrogenase  72.82 
 
 		 487 aa  748    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0388139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3841  betaine aldehyde dehydrogenase  74.18 
 
 		 489 aa  769    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1120  betaine aldehyde dehydrogenase  72.88 
 
 		 487 aa  738    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2588  betaine aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 491 aa  1014    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1947  betaine aldehyde dehydrogenase  73.71 
 
 		 488 aa  753    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.614027  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2071  betaine aldehyde dehydrogenase  73.08 
 
 		 488 aa  741    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3036  betaine aldehyde dehydrogenase  73.1 
 
 		 487 aa  753    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0986408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06180  betaine aldehyde dehydrogenase  64.24 
 
 		 486 aa  633  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  61.16 
 
 		 490 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  60.96 
 
 		 494 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  59.34 
 
 		 490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1833  betaine aldehyde dehydrogenase  60.33 
 
 		 490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 490 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  59.13 
 
 		 490 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0374  betaine aldehyde dehydrogenase  60.33 
 
 		 490 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00268  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  60.74 
 
 		 490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3294  betaine aldehyde dehydrogenase  60.54 
 
 		 490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0327  betaine aldehyde dehydrogenase  60.33 
 
 		 490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0371  betaine aldehyde dehydrogenase  60.74 
 
 		 490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00271  hypothetical protein  60.74 
 
 		 490 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.802759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3311  betaine aldehyde dehydrogenase  60.54 
 
 		 490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  60.38 
 
 		 489 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  60.38 
 
 		 489 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0343  betaine aldehyde dehydrogenase  60.33 
 
 		 490 aa  567  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  58.06 
 
 		 490 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3537  betaine aldehyde dehydrogenase  60.59 
 
 		 489 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  59.13 
 
 		 490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  58.63 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  59.11 
 
 		 489 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 490 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  59.53 
 
 		 489 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5099  betaine aldehyde dehydrogenase  59.96 
 
 		 489 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 490 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3269  betaine aldehyde dehydrogenase  59.96 
 
 		 489 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 490 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0402  betaine aldehyde dehydrogenase  59.13 
 
 		 490 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0554  betaine aldehyde dehydrogenase  59.75 
 
 		 489 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  55.46 
 
 		 488 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5183  betaine aldehyde dehydrogenase  59.75 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0180  betaine aldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 489 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0915  betaine aldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 489 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4733  betaine aldehyde dehydrogenase  57.68 
 
 		 490 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1514  betaine aldehyde dehydrogenase  57.68 
 
 		 490 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0736273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1427  betaine aldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 489 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  58.51 
 
 		 490 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1073  betaine aldehyde dehydrogenase  58.63 
 
 		 492 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000506243  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1924  betaine aldehyde dehydrogenase  58.63 
 
 		 489 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00178825  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0467  betaine aldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 489 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1836  betaine aldehyde dehydrogenase  58.42 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0376  betaine aldehyde dehydrogenase  58.42 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0441  betaine aldehyde dehydrogenase BADH  57.26 
 
 		 490 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558402  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0729  betaine aldehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 500 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  53.61 
 
 		 487 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0873  betaine aldehyde dehydrogenase  58.51 
 
 		 504 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0777  betaine aldehyde dehydrogenase  53.2 
 
 		 487 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549042  normal  0.0734216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  53.51 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0890  betaine aldehyde dehydrogenase  53.61 
 
 		 487 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187132  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0855  betaine aldehyde dehydrogenase  53.72 
 
 		 483 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2183  betaine aldehyde dehydrogenase  53.31 
 
 		 483 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  51.86 
 
 		 485 aa  521  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2710  betaine aldehyde dehydrogenase  53.93 
 
 		 487 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4370  betaine aldehyde dehydrogenase  56.76 
 
 		 486 aa  512  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8400  betaine aldehyde dehydrogenase  56.42 
 
 		 489 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0552  betaine aldehyde dehydrogenase  53.1 
 
 		 487 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1493  betaine aldehyde dehydrogenase  51.24 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0553  betaine aldehyde dehydrogenase  52.89 
 
 		 487 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01430  betaine aldehyde dehydrogenase (BadH), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04080)  52.28 
 
 		 497 aa  485  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0771988  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0990  betaine aldehyde dehydrogenase  53.53 
 
 		 487 aa  481  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760814  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1897  betaine aldehyde dehydrogenase  51.36 
 
 		 481 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.38 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  44.96 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.17 
 
 		 494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  44.23 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  44.75 
 
 		 494 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  44.75 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 		 494 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.54 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  44.75 
 
 		 494 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.54 
 
 		 494 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  43.7 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  44.54 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.49 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.49 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>