More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000365 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3841  betaine aldehyde dehydrogenase  65.49 
 
 
489 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1008  betaine aldehyde dehydrogenase  65.77 
 
 
487 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  63.45 
 
 
490 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02641  betaine aldehyde dehydrogenase  66.18 
 
 
488 aa  643    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1197  betaine aldehyde dehydrogenase  65.49 
 
 
487 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1324  betaine aldehyde dehydrogenase  66.26 
 
 
487 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
486 aa  1009    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3036  betaine aldehyde dehydrogenase  66.46 
 
 
487 aa  663    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0986408  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1120  betaine aldehyde dehydrogenase  65.07 
 
 
487 aa  637    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  70.72 
 
 
485 aa  724    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06180  betaine aldehyde dehydrogenase  89.07 
 
 
486 aa  914    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1314  betaine aldehyde dehydrogenase  66.26 
 
 
487 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0714  betaine aldehyde dehydrogenase  65.77 
 
 
487 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0388139  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2588  betaine aldehyde dehydrogenase  64.45 
 
 
491 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1947  betaine aldehyde dehydrogenase  66.11 
 
 
488 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.614027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1350  betaine aldehyde dehydrogenase  66.26 
 
 
487 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259029  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  63.04 
 
 
490 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2071  betaine aldehyde dehydrogenase  65.28 
 
 
488 aa  635    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  63.54 
 
 
489 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  63.54 
 
 
489 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  62.92 
 
 
489 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  63.12 
 
 
489 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4011  betaine aldehyde dehydrogenase  64.03 
 
 
487 aa  628  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213647  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3537  betaine aldehyde dehydrogenase  64.38 
 
 
489 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  61.3 
 
 
494 aa  626  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5183  betaine aldehyde dehydrogenase  63.33 
 
 
489 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  62.27 
 
 
490 aa  621  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1333  betaine aldehyde dehydrogenase  63.62 
 
 
487 aa  623  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0554  betaine aldehyde dehydrogenase  63.75 
 
 
489 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3269  betaine aldehyde dehydrogenase  63.54 
 
 
489 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5099  betaine aldehyde dehydrogenase  63.54 
 
 
489 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  61.78 
 
 
489 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  62.89 
 
 
490 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0915  betaine aldehyde dehydrogenase  62.81 
 
 
489 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101083  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1427  betaine aldehyde dehydrogenase  62.81 
 
 
489 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0376  betaine aldehyde dehydrogenase  63.02 
 
 
489 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1836  betaine aldehyde dehydrogenase  63.02 
 
 
489 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1073  betaine aldehyde dehydrogenase  63.02 
 
 
492 aa  621  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000506243  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0467  betaine aldehyde dehydrogenase  62.81 
 
 
489 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0180  betaine aldehyde dehydrogenase  62.81 
 
 
489 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  62.79 
 
 
490 aa  617  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1924  betaine aldehyde dehydrogenase  62.6 
 
 
489 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00178825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  61.44 
 
 
490 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1514  betaine aldehyde dehydrogenase  63.3 
 
 
490 aa  610  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0736273  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0873  betaine aldehyde dehydrogenase  63.52 
 
 
504 aa  600  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1833  betaine aldehyde dehydrogenase  61.54 
 
 
490 aa  599  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0402  betaine aldehyde dehydrogenase  61.75 
 
 
490 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  61.95 
 
 
490 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3294  betaine aldehyde dehydrogenase  61.95 
 
 
490 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  61.95 
 
 
490 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  61.75 
 
 
490 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0327  betaine aldehyde dehydrogenase  62.37 
 
 
490 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  61.6 
 
 
490 aa  597  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0374  betaine aldehyde dehydrogenase  62.37 
 
 
490 aa  597  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00268  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  61.95 
 
 
490 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3311  betaine aldehyde dehydrogenase  61.54 
 
 
490 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4733  betaine aldehyde dehydrogenase  60.57 
 
 
490 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0371  betaine aldehyde dehydrogenase  61.95 
 
 
490 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00271  hypothetical protein  61.95 
 
 
490 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.802759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0441  betaine aldehyde dehydrogenase BADH  60.16 
 
 
490 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558402  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0729  betaine aldehyde dehydrogenase  62.09 
 
 
500 aa  589  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0343  betaine aldehyde dehydrogenase  61.75 
 
 
490 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8400  betaine aldehyde dehydrogenase  59.54 
 
 
489 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  54.36 
 
 
488 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4370  betaine aldehyde dehydrogenase  57.23 
 
 
486 aa  532  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0777  betaine aldehyde dehydrogenase  53.11 
 
 
487 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549042  normal  0.0734216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  53.11 
 
 
487 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  52.6 
 
 
483 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0890  betaine aldehyde dehydrogenase  52.07 
 
 
487 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187132  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2710  betaine aldehyde dehydrogenase  53.22 
 
 
487 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0855  betaine aldehyde dehydrogenase  52.81 
 
 
483 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2183  betaine aldehyde dehydrogenase  52.6 
 
 
483 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0552  betaine aldehyde dehydrogenase  53.43 
 
 
487 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183899  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0553  betaine aldehyde dehydrogenase  53.64 
 
 
487 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  51.56 
 
 
485 aa  504  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0990  betaine aldehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
487 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760814  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1493  betaine aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
481 aa  491  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330699  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1897  betaine aldehyde dehydrogenase  51.98 
 
 
481 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.332328 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01430  betaine aldehyde dehydrogenase (BadH), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04080)  51.15 
 
 
497 aa  480  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0771988  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
494 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
494 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
494 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
494 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
494 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.84 
 
 
494 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
490 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 
494 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.63 
 
 
494 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  42.92 
 
 
492 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 
497 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.63 
 
 
494 aa  412  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  43.42 
 
 
494 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.04 
 
 
508 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  42.29 
 
 
483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
491 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  40.62 
 
 
483 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  42.74 
 
 
490 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.16 
 
 
494 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.47 
 
 
490 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>