More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1868 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  100 
 
 
492 aa  1010    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  62.47 
 
 
490 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  64.02 
 
 
490 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  61.46 
 
 
490 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  62.11 
 
 
494 aa  624  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  58.9 
 
 
497 aa  580  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  65.94 
 
 
421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  57.86 
 
 
496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  57.93 
 
 
473 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  58.02 
 
 
494 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  58.02 
 
 
494 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  57.38 
 
 
494 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  57.38 
 
 
494 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  57.38 
 
 
494 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  57.59 
 
 
494 aa  566  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  57.81 
 
 
494 aa  567  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  57.38 
 
 
494 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  57.38 
 
 
494 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  57.59 
 
 
494 aa  567  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  53.96 
 
 
494 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  54.93 
 
 
494 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  53.75 
 
 
494 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  53.96 
 
 
494 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  53.75 
 
 
494 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  53.75 
 
 
494 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  54.93 
 
 
494 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  54.72 
 
 
494 aa  548  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  54.72 
 
 
494 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  54.51 
 
 
494 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  56.19 
 
 
497 aa  527  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.17 
 
 
498 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  51.04 
 
 
483 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
490 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  50.5 
 
 
501 aa  486  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.59 
 
 
494 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  48.43 
 
 
506 aa  484  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.42 
 
 
508 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
483 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  50.41 
 
 
494 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  52.74 
 
 
495 aa  477  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  49.06 
 
 
483 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  48.63 
 
 
495 aa  473  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  50.73 
 
 
507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3822  Aldehyde Dehydrogenase  51.26 
 
 
498 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.21672  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.49 
 
 
496 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152099  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6857  aldehyde dehydrogenase  50.9 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0656347  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  50.84 
 
 
524 aa  467  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  49.17 
 
 
496 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  48.96 
 
 
497 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  48.96 
 
 
497 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  48.55 
 
 
497 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.96 
 
 
494 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.85 
 
 
484 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  48.42 
 
 
494 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3350  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222349  normal  0.605531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  47.93 
 
 
497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.37 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  47.6 
 
 
504 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  50.95 
 
 
495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4862  Betaine-aldehyde dehydrogenase  51.15 
 
 
498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  48.74 
 
 
492 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  49.16 
 
 
511 aa  450  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  48.65 
 
 
501 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.26 
 
 
496 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  45.72 
 
 
488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.14 
 
 
488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4074  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.55 
 
 
499 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  45.42 
 
 
492 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  46.97 
 
 
488 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.3 
 
 
488 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
488 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
488 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.96 
 
 
493 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  46.56 
 
 
490 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
501 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  47.76 
 
 
510 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  45.4 
 
 
502 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.65 
 
 
501 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 
501 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
488 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.75 
 
 
505 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5228  aldehyde dehydrogenase  48.44 
 
 
501 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  47.61 
 
 
501 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3311  aldehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
501 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  47.29 
 
 
510 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5188  aldehyde dehydrogenase  48.43 
 
 
526 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536573  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0851  Aldehyde Dehydrogenase  49.14 
 
 
480 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  46.54 
 
 
493 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  48.43 
 
 
497 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  47.17 
 
 
489 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  47.17 
 
 
489 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5278  aldehyde dehydrogenase family protein  48.22 
 
 
497 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  47.17 
 
 
488 aa  430  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  47.17 
 
 
488 aa  430  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  48.12 
 
 
513 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.57 
 
 
484 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.9 
 
 
496 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  45.91 
 
 
493 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  47.69 
 
 
493 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.17 
 
 
498 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>