More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0990 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0990  betaine aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  973    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4370  betaine aldehyde dehydrogenase  63.96 
 
 
486 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1333  betaine aldehyde dehydrogenase  56.31 
 
 
487 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  58.16 
 
 
489 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1197  betaine aldehyde dehydrogenase  54.89 
 
 
487 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  57.95 
 
 
489 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  57 
 
 
490 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  56.39 
 
 
488 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  56.79 
 
 
490 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4011  betaine aldehyde dehydrogenase  55.28 
 
 
487 aa  548  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.213647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  53.73 
 
 
485 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  57 
 
 
487 aa  545  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0714  betaine aldehyde dehydrogenase  55.39 
 
 
487 aa  547  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0388139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3841  betaine aldehyde dehydrogenase  56.22 
 
 
489 aa  548  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0777  betaine aldehyde dehydrogenase  57.4 
 
 
487 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549042  normal  0.0734216 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  57.35 
 
 
489 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0890  betaine aldehyde dehydrogenase  56.39 
 
 
487 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187132  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
489 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  55.65 
 
 
494 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
486 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  56.88 
 
 
483 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1008  betaine aldehyde dehydrogenase  54.36 
 
 
487 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1120  betaine aldehyde dehydrogenase  54.15 
 
 
487 aa  537  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2710  betaine aldehyde dehydrogenase  59.22 
 
 
487 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
489 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3036  betaine aldehyde dehydrogenase  53.99 
 
 
487 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0986408  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0553  betaine aldehyde dehydrogenase  56.24 
 
 
487 aa  532  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1324  betaine aldehyde dehydrogenase  53.99 
 
 
487 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  57.39 
 
 
490 aa  531  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1314  betaine aldehyde dehydrogenase  53.99 
 
 
487 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1350  betaine aldehyde dehydrogenase  53.48 
 
 
487 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259029  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2588  betaine aldehyde dehydrogenase  53.53 
 
 
491 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0552  betaine aldehyde dehydrogenase  56.03 
 
 
487 aa  529  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183899  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06180  betaine aldehyde dehydrogenase  53.11 
 
 
486 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3537  betaine aldehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
489 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1947  betaine aldehyde dehydrogenase  53.11 
 
 
488 aa  528  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.614027  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5183  betaine aldehyde dehydrogenase  56.51 
 
 
489 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5099  betaine aldehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
489 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0554  betaine aldehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
489 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3269  betaine aldehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
489 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2071  betaine aldehyde dehydrogenase  52.8 
 
 
488 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02641  betaine aldehyde dehydrogenase  53.21 
 
 
488 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1514  betaine aldehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
490 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0736273  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0915  betaine aldehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101083  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0467  betaine aldehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0180  betaine aldehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1073  betaine aldehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
492 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000506243  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0855  betaine aldehyde dehydrogenase  56.67 
 
 
483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1427  betaine aldehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
489 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1836  betaine aldehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
489 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  54.18 
 
 
490 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1924  betaine aldehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
489 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00178825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0376  betaine aldehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
489 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  53.64 
 
 
490 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2183  betaine aldehyde dehydrogenase  56.25 
 
 
483 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  54.68 
 
 
485 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1493  betaine aldehyde dehydrogenase  56.52 
 
 
481 aa  509  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.330699  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0374  betaine aldehyde dehydrogenase  55.19 
 
 
490 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1833  betaine aldehyde dehydrogenase  56.53 
 
 
490 aa  511  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.330385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00268  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  54.73 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3294  betaine aldehyde dehydrogenase  54.77 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00271  hypothetical protein  54.73 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.802759  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0371  betaine aldehyde dehydrogenase  54.98 
 
 
490 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0402  betaine aldehyde dehydrogenase  54.34 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0327  betaine aldehyde dehydrogenase  54.98 
 
 
490 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3311  betaine aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 
490 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5063  betaine aldehyde dehydrogenase  55.01 
 
 
490 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921344  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1897  betaine aldehyde dehydrogenase  57.64 
 
 
481 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  55.01 
 
 
490 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4936  betaine aldehyde dehydrogenase  55.01 
 
 
490 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208261  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  54.6 
 
 
490 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0343  betaine aldehyde dehydrogenase  54.77 
 
 
490 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0441  betaine aldehyde dehydrogenase BADH  53.5 
 
 
490 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558402  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8400  betaine aldehyde dehydrogenase  57.74 
 
 
489 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2830  betaine aldehyde dehydrogenase  53.1 
 
 
490 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4733  betaine aldehyde dehydrogenase  53.5 
 
 
490 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0729  betaine aldehyde dehydrogenase  53.52 
 
 
500 aa  495  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0873  betaine aldehyde dehydrogenase  54.8 
 
 
504 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01430  betaine aldehyde dehydrogenase (BadH), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04080)  47.19 
 
 
497 aa  437  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0771988  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.67 
 
 
496 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  46.04 
 
 
497 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
494 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  44.98 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  44.98 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  44.98 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  45.57 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.98 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  44.98 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.77 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  47.29 
 
 
473 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 
494 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 
490 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  44.35 
 
 
494 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
494 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.57 
 
 
498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.92 
 
 
490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  44.71 
 
 
490 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  43.12 
 
 
494 aa  402  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.91 
 
 
496 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  43.82 
 
 
491 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>