More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3376 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
488 aa  993    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  94.88 
 
 
488 aa  935    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  81.97 
 
 
487 aa  802    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  94.88 
 
 
488 aa  943    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  73.77 
 
 
492 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  89.55 
 
 
488 aa  907    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  95.08 
 
 
488 aa  945    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  95.08 
 
 
488 aa  945    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  97.95 
 
 
488 aa  967    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  48.12 
 
 
490 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.79 
 
 
496 aa  478  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  48.22 
 
 
473 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  48.95 
 
 
497 aa  463  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.74 
 
 
490 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  46.56 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
494 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  46.36 
 
 
506 aa  458  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  46.76 
 
 
490 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  45.82 
 
 
494 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
494 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.4 
 
 
494 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
494 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
494 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
494 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  44.68 
 
 
494 aa  448  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  46.03 
 
 
494 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
494 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.4 
 
 
494 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  45.4 
 
 
494 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.68 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  44.89 
 
 
494 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  44.68 
 
 
494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  44.89 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.97 
 
 
498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.89 
 
 
494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  44.89 
 
 
494 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.68 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.09 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  45.51 
 
 
492 aa  445  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  45.05 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  43.93 
 
 
488 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  45.47 
 
 
499 aa  438  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  45.34 
 
 
502 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  43.72 
 
 
488 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  46.78 
 
 
491 aa  435  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  44.12 
 
 
494 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  46.56 
 
 
494 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  44.86 
 
 
501 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  46.44 
 
 
493 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.57 
 
 
491 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  47.3 
 
 
501 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
501 aa  429  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  46.44 
 
 
493 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  46.23 
 
 
493 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  43.22 
 
 
486 aa  428  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.25 
 
 
494 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.64 
 
 
508 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  45.85 
 
 
483 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
489 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
493 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.03 
 
 
493 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.74 
 
 
496 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152099  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  46.01 
 
 
483 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1623  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.29 
 
 
499 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207083  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
483 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  47.79 
 
 
494 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  45.82 
 
 
493 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.7 
 
 
505 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  43.91 
 
 
495 aa  421  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  46.47 
 
 
501 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
495 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  46.43 
 
 
490 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5173  Aldehyde Dehydrogenase  44.72 
 
 
503 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.89 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 
495 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  41.65 
 
 
495 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  44.99 
 
 
511 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  44.92 
 
 
497 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  47.47 
 
 
421 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  44.42 
 
 
524 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  46.47 
 
 
501 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  46.23 
 
 
529 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  41.65 
 
 
495 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.63 
 
 
494 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3311  aldehyde dehydrogenase  46.47 
 
 
501 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  44.77 
 
 
494 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  40.66 
 
 
490 aa  412  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.77 
 
 
493 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  43.96 
 
 
491 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  46.43 
 
 
495 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.64 
 
 
484 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5228  aldehyde dehydrogenase  46.27 
 
 
501 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
495 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.12 
 
 
496 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  44.35 
 
 
495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1326  elongation factor P (EF-P)  42.68 
 
 
491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 
495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  44.1 
 
 
495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>