More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3513 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2225  aldehyde dehydrogenase  63.71 
 
 		 495 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 495 aa  1006    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0330  phenylacetaldehyde dehydrogenase  61.49 
 
 		 495 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587871  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0108  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  58.35 
 
 		 497 aa  618  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  57.46 
 
 		 493 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4998  aldehyde dehydrogenase  55.24 
 
 		 495 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3139  aldehyde dehydrogenase  54.64 
 
 		 495 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3305  phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.44 
 
 		 494 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3474  phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.44 
 
 		 494 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3379  phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.24 
 
 		 494 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.24 
 
 		 494 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3300  phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.44 
 
 		 494 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.47 
 
 		 500 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.88 
 
 		 500 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.88 
 
 		 500 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.88 
 
 		 500 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.67 
 
 		 500 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.08 
 
 		 500 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  47 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 573 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0628  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.596423  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0348  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1365  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0943  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0371587  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  47.72 
 
 		 492 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 500 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 		 499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 		 499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01357  phenylacetaldehyde dehydrogenase  45.25 
 
 		 499 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01370  hypothetical protein  45.25 
 
 		 499 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  45.27 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 497 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 497 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  44.27 
 
 		 497 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  44.67 
 
 		 497 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  44.22 
 
 		 501 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11190  putative aldehyde dehydrogenase  44.74 
 
 		 495 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.02 
 
 		 501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  44.38 
 
 		 501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3311  aldehyde dehydrogenase  43.41 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  43.41 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5228  aldehyde dehydrogenase  43 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1028  putative aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.44 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3102  aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4074  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.06 
 
 		 499 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0057  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0727392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0058  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3290  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2663  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2715  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0272  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.94 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1837  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.91 
 
 		 494 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  43.78 
 
 		 494 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.65 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 		 494 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3350  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 		 502 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222349  normal  0.605531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.51 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  38.51 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  38.71 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  38.71 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.51 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  38.71 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.71 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  38.51 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  39.68 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  39.47 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.47 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.47 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.27 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  41.21 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.9 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  40.71 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0766  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.39 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  39.96 
 
 		 524 aa  368  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3811  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.86 
 
 		 502 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505255  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  40.66 
 
 		 504 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 		 494 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  39.04 
 
 		 490 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.4 
 
 		 508 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.63 
 
 		 494 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.34 
 
 		 488 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  39 
 
 		 490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  38.8 
 
 		 490 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 488 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  42 
 
 		 488 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>