More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2260 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01357  phenylacetaldehyde dehydrogenase  99.4 
 
 
499 aa  1017    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
499 aa  1026    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  100 
 
 
499 aa  1026    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  99.6 
 
 
499 aa  1020    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  74.75 
 
 
499 aa  781    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01370  hypothetical protein  99.4 
 
 
499 aa  1017    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  99.6 
 
 
499 aa  1020    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.6 
 
 
500 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.4 
 
 
500 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.8 
 
 
500 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.03 
 
 
500 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.03 
 
 
500 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.03 
 
 
500 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1365  phenylacetaldehyde dehydrogenase  54.14 
 
 
500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0628  phenylacetaldehyde dehydrogenase  54.14 
 
 
500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.596423  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  54.14 
 
 
500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  54.14 
 
 
500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0943  phenylacetaldehyde dehydrogenase  54.14 
 
 
500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0371587  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0348  phenylacetaldehyde dehydrogenase  54.14 
 
 
500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  53.94 
 
 
500 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  53.33 
 
 
573 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  49.27 
 
 
492 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.41 
 
 
501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0108  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
497 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11190  putative aldehyde dehydrogenase  48.58 
 
 
495 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3290  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2715  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2663  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0058  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  50 
 
 
501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 
495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3139  aldehyde dehydrogenase  46.87 
 
 
495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4998  aldehyde dehydrogenase  46.87 
 
 
495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0057  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
501 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0727392  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  44.74 
 
 
493 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0272  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50 
 
 
501 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  44.98 
 
 
501 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1028  putative aldehyde dehydrogenase  47.77 
 
 
495 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.83 
 
 
496 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1837  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50 
 
 
501 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3350  aldehyde dehydrogenase  47.86 
 
 
502 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222349  normal  0.605531 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  45.58 
 
 
501 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.98 
 
 
501 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2225  aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
495 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  46.25 
 
 
504 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  44.04 
 
 
494 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3311  aldehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
501 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  44.38 
 
 
501 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5228  aldehyde dehydrogenase  44.18 
 
 
501 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3379  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
494 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3474  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
494 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 
494 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3300  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
494 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3305  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
494 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.23 
 
 
494 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  42.97 
 
 
494 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.42 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
497 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  44.4 
 
 
497 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.63 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
497 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.54 
 
 
501 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  42.57 
 
 
497 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 
497 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  44.15 
 
 
494 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.16 
 
 
494 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0330  phenylacetaldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 
495 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.26 
 
 
496 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  44.03 
 
 
473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4074  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.36 
 
 
499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
494 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.36 
 
 
494 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.36 
 
 
494 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.56 
 
 
494 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.36 
 
 
494 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40.36 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.36 
 
 
494 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.13 
 
 
494 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4862  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.31 
 
 
498 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  42.46 
 
 
494 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  41.77 
 
 
510 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  43.15 
 
 
507 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3102  aldehyde dehydrogenase  41.24 
 
 
502 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3811  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.47 
 
 
502 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
483 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.97 
 
 
490 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
495 aa  384  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.81 
 
 
498 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 
494 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.18 
 
 
490 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  41.84 
 
 
483 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3822  Aldehyde Dehydrogenase  41.25 
 
 
498 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.21672  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.83 
 
 
492 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  41.54 
 
 
490 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>