More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2474 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  98.79 
 
 		 497 aa  1009    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  96.38 
 
 		 497 aa  973    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  98.79 
 
 		 497 aa  1008    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 497 aa  1016    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  61.94 
 
 		 501 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  61.1 
 
 		 501 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  62.12 
 
 		 501 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5228  aldehyde dehydrogenase  61.91 
 
 		 501 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3311  aldehyde dehydrogenase  62.12 
 
 		 501 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  61.26 
 
 		 501 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3350  aldehyde dehydrogenase  62.01 
 
 		 502 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222349  normal  0.605531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0766  Betaine-aldehyde dehydrogenase  63.52 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.91 
 
 		 496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4074  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  59.51 
 
 		 499 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  55.65 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.5 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.29 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  52.37 
 
 		 494 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  52.37 
 
 		 494 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  52.37 
 
 		 494 aa  529  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  52.37 
 
 		 494 aa  529  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.21 
 
 		 501 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.09 
 
 		 500 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  53.27 
 
 		 497 aa  528  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  52.37 
 
 		 494 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  52.58 
 
 		 494 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  52.16 
 
 		 494 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.67 
 
 		 500 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.67 
 
 		 500 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  52.58 
 
 		 494 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.67 
 
 		 500 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  52.37 
 
 		 494 aa  525  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11190  putative aldehyde dehydrogenase  57.93 
 
 		 495 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  52.37 
 
 		 494 aa  525  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  53.67 
 
 		 492 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.9 
 
 		 501 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0348  phenylacetaldehyde dehydrogenase  53.91 
 
 		 500 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0943  phenylacetaldehyde dehydrogenase  53.91 
 
 		 500 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0371587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1365  phenylacetaldehyde dehydrogenase  53.91 
 
 		 500 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  53.91 
 
 		 500 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  53.91 
 
 		 573 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  53.91 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0628  phenylacetaldehyde dehydrogenase  53.91 
 
 		 500 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.596423  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  53.91 
 
 		 500 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1028  putative aldehyde dehydrogenase  57.72 
 
 		 495 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4862  Betaine-aldehyde dehydrogenase  54.42 
 
 		 498 aa  508  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  47.99 
 
 		 494 aa  501  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  47.99 
 
 		 494 aa  501  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.19 
 
 		 494 aa  503  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.79 
 
 		 494 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  47.59 
 
 		 494 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  47.79 
 
 		 494 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.79 
 
 		 494 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  48.19 
 
 		 494 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  47.59 
 
 		 494 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3102  aldehyde dehydrogenase  50.3 
 
 		 502 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  47.39 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  51.43 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3822  Aldehyde Dehydrogenase  52.85 
 
 		 498 aa  492  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.21672  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2663  phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.91 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3290  phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.91 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0058  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2715  phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.91 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  49.59 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0272  phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.91 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1837  phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.82 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0057  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0727392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.36 
 
 		 494 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3811  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.12 
 
 		 502 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505255  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  52.05 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  49.19 
 
 		 504 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2869  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.84 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179484  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  48.55 
 
 		 492 aa  466  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  47.92 
 
 		 490 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.12 
 
 		 490 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  46.77 
 
 		 490 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 		 494 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3753  aldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.16 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3244  aldehyde dehydrogenase  51.42 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.685717  normal  0.437136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2225  aldehyde dehydrogenase  46.28 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  42.39 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  48.23 
 
 		 510 aa  438  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4806  aldehyde dehydrogenase  49.18 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  44.27 
 
 		 495 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.61 
 
 		 498 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 493 aa  435  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  45.84 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6857  aldehyde dehydrogenase  48.35 
 
 		 502 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0656347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4503  aldehyde dehydrogenase  47.95 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  42.57 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  43.8 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  43.54 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  42.57 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.18 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  42.36 
 
 		 499 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  42.36 
 
 		 499 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01357  phenylacetaldehyde dehydrogenase  42.36 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.19 
 
 		 496 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>