More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2225 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  63.71 
 
 		 495 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2225  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 495 aa  1006    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0330  phenylacetaldehyde dehydrogenase  65.45 
 
 		 495 aa  669    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  60 
 
 		 493 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0108  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  58.55 
 
 		 497 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3139  aldehyde dehydrogenase  55.24 
 
 		 495 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4998  aldehyde dehydrogenase  55.44 
 
 		 495 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  54.73 
 
 		 494 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3474  phenylacetaldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 		 494 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3379  phenylacetaldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 		 494 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3300  phenylacetaldehyde dehydrogenase  54.53 
 
 		 494 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3305  phenylacetaldehyde dehydrogenase  54.33 
 
 		 494 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.12 
 
 		 500 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.12 
 
 		 500 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.12 
 
 		 500 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.51 
 
 		 500 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.72 
 
 		 500 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  51.63 
 
 		 573 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1365  phenylacetaldehyde dehydrogenase  51.43 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0348  phenylacetaldehyde dehydrogenase  51.43 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  51.43 
 
 		 500 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0628  phenylacetaldehyde dehydrogenase  51.43 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.596423  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0943  phenylacetaldehyde dehydrogenase  51.43 
 
 		 500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0371587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  51.22 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  51.22 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 		 497 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  46.88 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 		 497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  46.28 
 
 		 497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11190  putative aldehyde dehydrogenase  48.58 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01357  phenylacetaldehyde dehydrogenase  45.66 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01370  hypothetical protein  45.66 
 
 		 499 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  48.55 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1028  putative aldehyde dehydrogenase  47.77 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.94 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  43.12 
 
 		 501 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5228  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3311  aldehyde dehydrogenase  44.02 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.78 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3102  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 		 502 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  44.76 
 
 		 501 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.65 
 
 		 496 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4074  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.63 
 
 		 499 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3350  aldehyde dehydrogenase  44.86 
 
 		 502 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222349  normal  0.605531 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  42.71 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  39.84 
 
 		 494 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0766  Betaine-aldehyde dehydrogenase  46.41 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.21 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  42.27 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4862  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3290  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3811  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.65 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0058  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.53 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2663  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0272  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40.33 
 
 		 490 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1837  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  40.54 
 
 		 490 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2715  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0057  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0727392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  39.24 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  39.24 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.03 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.03 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  39.24 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  42.05 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.27 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.03 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  39.47 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.47 
 
 		 494 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  39.24 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.15 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  39.88 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.68 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.11 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  38.92 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 		 488 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 		 488 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  39.47 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.96 
 
 		 488 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.38 
 
 		 488 aa  362  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 		 488 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 		 488 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.43 
 
 		 498 aa  361  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>