More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3139 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3139  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
495 aa  1005    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4998  aldehyde dehydrogenase  98.79 
 
 
495 aa  994    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.427023  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0108  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  56.34 
 
 
497 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3513  aldehyde dehydrogenase  54.64 
 
 
495 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.429335 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  51.72 
 
 
493 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0330  phenylacetaldehyde dehydrogenase  57.06 
 
 
495 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2225  aldehyde dehydrogenase  55.24 
 
 
495 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  50 
 
 
494 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3305  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.8 
 
 
494 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3379  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.6 
 
 
494 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3300  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.6 
 
 
494 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3474  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.6 
 
 
494 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.77 
 
 
500 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.77 
 
 
500 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.77 
 
 
500 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  46.87 
 
 
499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  46.87 
 
 
499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.77 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  46.87 
 
 
499 aa  445  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01357  phenylacetaldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
499 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  46.87 
 
 
499 aa  445  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01370  hypothetical protein  46.67 
 
 
499 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.39 
 
 
573 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.09 
 
 
500 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.09 
 
 
500 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  45.64 
 
 
499 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1365  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.09 
 
 
500 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0348  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.09 
 
 
500 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  48.89 
 
 
500 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0943  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.09 
 
 
500 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0371587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0628  phenylacetaldehyde dehydrogenase  49.09 
 
 
500 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.596423  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11190  putative aldehyde dehydrogenase  45.7 
 
 
495 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  44.4 
 
 
492 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1028  putative aldehyde dehydrogenase  44.88 
 
 
495 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  43.41 
 
 
501 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
497 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
497 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
501 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3350  aldehyde dehydrogenase  42.02 
 
 
502 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222349  normal  0.605531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  41.78 
 
 
497 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  41.78 
 
 
497 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.8 
 
 
501 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 
501 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.6 
 
 
501 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4074  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.06 
 
 
499 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5228  aldehyde dehydrogenase  42.02 
 
 
501 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3311  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
501 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
501 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.11 
 
 
498 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3811  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.57 
 
 
502 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2663  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
501 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1837  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
501 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3290  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
501 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2715  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
501 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0058  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 
501 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
483 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0057  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
501 aa  362  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0727392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0272  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 
501 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.25 
 
 
508 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  40.85 
 
 
494 aa  355  7.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3102  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 
502 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.37 
 
 
496 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  39.61 
 
 
490 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.97 
 
 
494 aa  348  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.17 
 
 
494 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 
494 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.97 
 
 
494 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 
494 aa  347  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  40.54 
 
 
494 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  39.54 
 
 
473 aa  345  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  40.5 
 
 
483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  36.77 
 
 
494 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  36.77 
 
 
494 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.57 
 
 
494 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  36.57 
 
 
494 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
494 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.98 
 
 
497 aa  343  5e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
504 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  38.76 
 
 
490 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.15 
 
 
490 aa  342  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  36.77 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  36.57 
 
 
494 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  36.57 
 
 
494 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  36.57 
 
 
494 aa  340  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  39.44 
 
 
494 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  36.57 
 
 
494 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  36.57 
 
 
494 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  39.59 
 
 
492 aa  339  7e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  36.57 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  36.57 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  36.77 
 
 
494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  36.57 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.04 
 
 
496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.01 
 
 
494 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2869  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.26 
 
 
504 aa  336  5.999999999999999e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4862  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 
498 aa  335  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0766  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.33 
 
 
500 aa  334  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>