More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3753 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3753  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
502 aa  1017    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34447  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4806  aldehyde dehydrogenase  64.13 
 
 
501 aa  588  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
497 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
497 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 
497 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
497 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.57 
 
 
501 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1995  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  49.57 
 
 
492 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.964387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.52 
 
 
496 aa  448  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3350  aldehyde dehydrogenase  49.28 
 
 
502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222349  normal  0.605531 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  47.69 
 
 
501 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.45 
 
 
500 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.25 
 
 
500 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3811  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49 
 
 
502 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  45.7 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
501 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.84 
 
 
500 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.84 
 
 
500 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3311  aldehyde dehydrogenase  47.49 
 
 
501 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.84 
 
 
500 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5228  aldehyde dehydrogenase  47.29 
 
 
501 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.64 
 
 
500 aa  435  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  45.03 
 
 
473 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1028  putative aldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
495 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11190  putative aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
495 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.22 
 
 
501 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 
500 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 
500 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1365  phenylacetaldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 
500 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 
500 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0943  phenylacetaldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 
500 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0371587  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  46.44 
 
 
573 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0628  phenylacetaldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 
500 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.596423  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0348  phenylacetaldehyde dehydrogenase  47.05 
 
 
500 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
494 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4074  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.4 
 
 
499 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.03 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  42.83 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  43.03 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  43.24 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
499 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.01 
 
 
494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3102  aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.42 
 
 
494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.25 
 
 
498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  45.73 
 
 
494 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3881  Aldehyde Dehydrogenase  47.28 
 
 
507 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  41.6 
 
 
494 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  41.73 
 
 
494 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0766  Betaine-aldehyde dehydrogenase  48.98 
 
 
500 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  41.6 
 
 
494 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4862  Betaine-aldehyde dehydrogenase  47.88 
 
 
498 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.59 
 
 
494 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.8 
 
 
494 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.53 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
499 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
499 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
499 aa  398  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01357  phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
499 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
499 aa  398  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01370  hypothetical protein  43.76 
 
 
499 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.9 
 
 
508 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2663  phenylacetaldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
501 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1837  phenylacetaldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
501 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0058  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
501 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3290  phenylacetaldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
501 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2715  phenylacetaldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
501 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0272  phenylacetaldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
501 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6857  aldehyde dehydrogenase  44.95 
 
 
502 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0656347  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0057  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  48.52 
 
 
501 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0727392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2605  aldehyde dehydrogenase  41.96 
 
 
494 aa  383  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000129908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3822  Aldehyde Dehydrogenase  44.38 
 
 
498 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.21672  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 
488 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 
490 aa  379  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  40.92 
 
 
501 aa  375  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0561  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
490 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2869  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.52 
 
 
504 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
496 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
483 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40.46 
 
 
490 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.58 
 
 
490 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  40.38 
 
 
506 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1691  aldehyde dehydrogenase  47.36 
 
 
494 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
492 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.74 
 
 
484 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0108  putative phenylacetaldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
497 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  42.23 
 
 
492 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  38.26 
 
 
493 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>