More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0658 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  36.61 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  34.68 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  34.18 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  34.18 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  34.18 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  32.91 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  35.44 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  35.44 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  35.44 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  35.44 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  35.44 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  35.44 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  35.44 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  34.18 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  27.44 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  34.81 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  32.91 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  32.91 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  36.75 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  32.5 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  33.53 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  31.45 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  36.44 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  26.83 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  34.34 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  31.45 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  30.82 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  31.87 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  30.19 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  30.19 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  31.87 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  32.35 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  32.35 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  31.87 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  37.17 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  31.87 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  30.19 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  32.7 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  29.93 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  34.45 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  34.45 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  32.7 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  32.7 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  30.18 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  32.7 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  32.7 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  32.7 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  32.7 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  26.11 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  25.68 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  25.68 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  25.68 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  25.68 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  29.59 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  28.21 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  26.34 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  25.88 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  24.44 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  25.86 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  37.23 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 677 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>