More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0554 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  99.49 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  91.19 
 
 		 194 aa  355  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  56.99 
 
 		 202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  57.44 
 
 		 211 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  54.97 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  53.76 
 
 		 189 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  50 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  50 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  53.65 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  50 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1151  transcriptional regulator TetR family  55.23 
 
 		 182 aa  178  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  40.11 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  40.11 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  40.11 
 
 		 195 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  40.11 
 
 		 195 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  40.11 
 
 		 195 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  40.11 
 
 		 195 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  40.11 
 
 		 202 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  40.21 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  41.15 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  39.58 
 
 		 194 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  40.31 
 
 		 194 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  40.31 
 
 		 194 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  38.02 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  38.54 
 
 		 194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 195 aa  134  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  36.55 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  38.38 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  39.79 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  36.79 
 
 		 195 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  37.76 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  38.66 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  36.27 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  37.76 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  37.76 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  37.37 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  37.37 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  38.66 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  38.1 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  39.18 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  37.36 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  38.1 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  35.03 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  37.99 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  39.18 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  39.18 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  39.18 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  37.57 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  37.57 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  39.18 
 
 		 195 aa  121  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  38.27 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  38.27 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  39.18 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  39.18 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  38.73 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  36.57 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  34.04 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  37.14 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  34.86 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  35.76 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  35.09 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  35.03 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  34.3 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  32.42 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  34.54 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 677 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>