More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1671 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 215 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  41.75 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  33.7 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  33.7 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  34.43 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  29.05 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  32.04 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  32.6 
 
 		 194 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  32.6 
 
 		 194 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  32.6 
 
 		 194 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  31.47 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  32.62 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  31.47 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  32.6 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  28.11 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  31.47 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  32.24 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  27.57 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  31.91 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  31.91 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  31.91 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  31.91 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  31.67 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  30.27 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  31.55 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  28 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  30.11 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  32 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  34.54 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  32.07 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  31.87 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  31.49 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  31.58 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  27.89 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  31.49 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  31.05 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  30.49 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  29.03 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  28.42 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  24.5 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  28.74 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  33.52 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  27.54 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  27.72 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  30.21 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  25.45 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 677 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  26.06 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  26.06 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  29.63 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  28.26 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  29.63 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  27.72 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  26.06 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  33.98 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  27.72 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  25.53 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  27.72 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  28.26 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  28.26 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  28.26 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  25.54 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  27.51 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  31.36 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  31.14 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  31.14 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>