More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4168 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  29.35 
 
 		 510 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 477 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 477 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 183 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  33.73 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 199 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  29.09 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 206 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  26.34 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  25.9 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0039  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 195 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.73 
 
 		 287 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  27.81 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  31.2 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  44.23 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 177 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  25.26 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  30.26 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  30 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  44.9 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>