More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  48.22 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  44.55 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  21.53 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  21.58 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  21.58 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  40.24 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  28.47 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  37.8 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  41.89 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  37.8 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  44.07 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 470 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  29.5 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  36.76 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>