More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0291 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3340  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  26.04 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  28.22 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  25.61 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 424 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  33.66 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  27.22 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  21.84 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  24.83 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  24.83 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 244 aa  48.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 229 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  26.04 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 677 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 267 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  23.97 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  32.29 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  23.29 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>