More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4599 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  443  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 309 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 403 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 400 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 408 aa  99  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 451 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 428 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 451 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 363 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 182 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 410 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 425 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  34.55 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 396 aa  85.5  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 424 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  28.48 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 391 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  33.88 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 412 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 412 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 470 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 394 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 394 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 394 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  32.48 
 
 		 278 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 388 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  31.22 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>