More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8904 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  63.64 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3898  regulatory protein TetR  34.33 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5540  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00941347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  31.25 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.43 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.43 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.43 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.43 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.43 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  33.06 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.08 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.26 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 421 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  58 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 291 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 289 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 182 aa  51.6  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 232 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 291 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.03 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  30.47 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 125 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.47 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  33.07 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  30.47 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.47 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.47 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 425 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.47 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>