More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5540 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5540  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00941347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3898  regulatory protein TetR  50.26 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  45 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  38.27 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  54.9 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 290 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 290 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 290 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 290 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 291 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 290 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 290 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 291 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 290 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  28.26 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  28.26 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 289 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  28.26 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  28.26 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  28.68 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  28.26 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  28.26 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 229 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  41.1 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  46.43 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  36.7 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  54.17 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 310 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>