More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1283 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 406 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 497 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  27.49 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  54 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  41.27 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  26.97 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  48.08 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 424 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 332 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 385 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  41.94 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 326 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 310 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  51.02 
 
 		 403 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  46.43 
 
 		 390 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  41.1 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 280 aa  52.4  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  35.59 
 
 		 112 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 400 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 271 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>