More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2057 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  417  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  61.45 
 
 		 208 aa  225  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  37.59 
 
 		 194 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  28.5 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  33.52 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  31.4 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 332 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  28.83 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  25.49 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  26.57 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3898  regulatory protein TetR  53.57 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  43.86 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  47.06 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>