More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3546 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  61.98 
 
 
212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  60.82 
 
 
212 aa  237  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  60.82 
 
 
212 aa  237  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  60.82 
 
 
212 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  54.87 
 
 
222 aa  204  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  53.16 
 
 
204 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  53.16 
 
 
204 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
237 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
201 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 
207 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 
186 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  34.41 
 
 
193 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
222 aa  61.6  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  30 
 
 
209 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 
194 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  42.19 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
231 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  45.76 
 
 
264 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
191 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 
191 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
297 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
244 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
235 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  32.88 
 
 
258 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 
223 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 
227 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 
255 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 
247 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
208 aa  54.7  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
195 aa  54.7  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_002950  PG1240  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
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NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0976848 
 
 
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NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
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NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.175697 
 
 
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NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146337 
 
 
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NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
305 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
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