More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2785 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  396  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  53.89 
 
 		 234 aa  214  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  53.4 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 193 aa  127  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 235 aa  84.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  29.75 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 246 aa  71.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  25.4 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  26.22 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.14 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  26.51 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.78 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  23.42 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  25.25 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0776  regulatory protein TetR  21.35 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.431978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  22.91 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  25.17 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>