33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0776 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0776  regulatory protein TetR  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.431978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0906  hypothetical protein  43.08 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  21.24 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  20.94 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  29 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  18.23 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  20.74 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  19.67 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 239 aa  45.4  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  19.15 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  21.62 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 209 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  20.21 
 
 		 212 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>