More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0828 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  84.54 
 
 		 194 aa  347  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 195 aa  279  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 195 aa  277  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 195 aa  275  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  66.67 
 
 		 195 aa  275  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  66.67 
 
 		 195 aa  275  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 195 aa  275  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  66.67 
 
 		 195 aa  275  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  66.15 
 
 		 195 aa  274  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  66.15 
 
 		 195 aa  274  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  66.15 
 
 		 195 aa  273  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 195 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 198 aa  191  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
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NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  46.96 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
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NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 200 aa  87.8  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 254 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
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NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
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NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
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NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
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NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
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NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
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NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
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NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
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