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for query gene Dgeo_0117 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  55.14 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 240 aa  104  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  28.19 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  33.5 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 256 aa  98.6  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  34.52 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 189 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  31.44 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  27.72 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 260 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  31.52 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 770 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
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NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
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NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
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NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
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NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
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NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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