More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3836 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  62.94 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  49.07 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 770 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  42.34 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 209 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 210 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 202 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 211 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 202 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 208 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 188 aa  86.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 194 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.02 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 424 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  20.65 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 207 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>