More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0306 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  54.38 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 188 aa  88.6  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 256 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.51 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.95 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.66 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  23.92 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
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NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
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NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  21.81 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
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NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
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NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
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NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
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NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
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NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
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