More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1591 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  52.86 
 
 		 207 aa  231  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 287 aa  134  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  32.4 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 200 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  27.37 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  27.27 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  26.84 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 297 aa  71.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  27.69 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  27.98 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  27.98 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  27.98 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  26.7 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  32.16 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  25.26 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  27.98 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  25.26 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  26.18 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.39 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  23.41 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  26.18 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 477 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  26.18 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  25.65 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 477 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  26.18 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  26.18 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  26.18 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  26.18 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  25.76 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  24.61 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  25.76 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  24.61 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  25.28 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  25.76 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  26.7 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  26.29 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  26.29 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  25.25 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  22.9 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  25.25 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4351  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.710621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  25.25 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  25.76 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  28.49 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  28.22 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  26.18 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6166  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  normal  0.0100509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  23.16 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  34.15 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>