More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3503 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  73.98 
 
 		 196 aa  296  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  45.92 
 
 		 197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.09 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  45.28 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  29.59 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  32.89 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  35.48 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  40 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  31.09 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  33.61 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  29.05 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  29.66 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  29.66 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  29.66 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  26.49 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  26.03 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  28.1 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  26.03 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  26.03 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  26.03 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  26.03 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  26.03 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  25.17 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  28.21 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  28.21 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  28.23 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  27.56 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  40.3 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  25.62 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  25.44 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  29.27 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  27.73 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  26.77 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>