More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22050 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  386  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  35.94 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  35.94 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  50 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  31.43 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.43 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.43 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.43 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.43 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.43 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  39.02 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  39.02 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  39.02 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  39.02 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  39.02 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  39.02 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  39.02 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4766  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1519  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1542  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1617  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.0770376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1597  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703325  normal  0.531377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1621  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  29.94 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0674  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1141  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412477  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 261 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>