208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0566 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
207 aa  410  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  79.9 
 
 
216 aa  330  7.000000000000001e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 
201 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  34.17 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 
200 aa  108  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 
208 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 
219 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  36.09 
 
 
217 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  31.46 
 
 
190 aa  95.5  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  29.45 
 
 
192 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
189 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  31.31 
 
 
236 aa  51.6  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
321 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 
197 aa  52  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  35 
 
 
199 aa  52  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  28.92 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  29.17 
 
 
196 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
223 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
211 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 
212 aa  48.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 
236 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
274 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  31.17 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
234 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
262 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 
223 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
187 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  20.53 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
305 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 
240 aa  45.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
194 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
243 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  32.18 
 
 
219 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
183 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 
196 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 
216 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
224 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.75 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  25.2 
 
 
241 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>