More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0439 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  46.82 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 208 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.96 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  28.48 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  34.66 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 236 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  35.83 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  29.9 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  25.95 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  31.72 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  41.54 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>