More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1173 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  86.57 
 
 		 205 aa  348  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1160  hypothetical protein  80.6 
 
 		 113 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 204 aa  107  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  45.52 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  34.17 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 178 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  34.66 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  32.98 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 204 aa  88.2  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  43.16 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  49.02 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  40 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27.23 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  47.17 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2925  regulatory protein TetR  27.89 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 287 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.61 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1971  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614274  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.58 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 393 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  35.62 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 497 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>