More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4581 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 453 aa  927    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  47.63 
 
 		 419 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 422 aa  353  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 424 aa  332  9e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 418 aa  242  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 240 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 223 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 256 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 205 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  27.56 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 770 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  30.61 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 195 aa  57  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 297 aa  57  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 219 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 193 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 211 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 187 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 201 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 207 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 196 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 192 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 223 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 182 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 197 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 201 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 214 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 239 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 195 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 208 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 209 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 211 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 226 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 208 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 211 aa  53.9  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 269 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 209 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 197 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  32.35 
 
 		 182 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 185 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 198 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 211 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 211 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 211 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 211 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 211 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 185 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 211 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 211 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 204 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 224 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 216 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 205 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  25.3 
 
 		 204 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 187 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  25.38 
 
 		 196 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 214 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 221 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 209 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  37.5 
 
 		 213 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 223 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 221 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  25 
 
 		 224 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 197 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 188 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 221 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 208 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 252 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  25.54 
 
 		 205 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 209 aa  51.2  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 198 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 214 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 188 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>