More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4041 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  362  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  80.77 
 
 		 182 aa  295  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  42.34 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 332 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 453 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  50 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  34.91 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  37.31 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 225 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 261 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 251 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  30 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 235 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 199 aa  51.2  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 183 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 205 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 205 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>