More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2783 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  55.8 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  53.04 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  53.04 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 428 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 415 aa  75.1  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  32.95 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  61.54 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  45.07 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  32.58 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  48.72 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  28.38 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 453 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 168 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 178 aa  51.6  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 239 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 255 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 288 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 288 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 321 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 237 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 321 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 321 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 321 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  48.5  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  48.9  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1181  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000866899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>