More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4086 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3709  regulatory protein TetR  49.05 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0548  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.42 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4338  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  46.94 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  44.44 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  43.55 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 98 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  40.79 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  34.88 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  40 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  35.71 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  29.51 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 205 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 196 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 198 aa  52  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 324 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 189 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
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NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
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