More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1601 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  443  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  91.3  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  27.36 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  24.16 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  34.78 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  50 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  28.21 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 87 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 335 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.5 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 261 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2939  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 360 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0355871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.81 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.31 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 191 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>