More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1181 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  410  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  21.94 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2923  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3115  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  24 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  40 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  43.75 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  38.89 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 332 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1914  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000166268  normal  0.222991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2423  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1665  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.271808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  21.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  30.93 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 72 aa  48.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 461 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  39.22 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  43.14 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  39.22 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>