More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1939 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  30.35 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  30.35 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  33 
 
 		 197 aa  84.7  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  24.28 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  26.02 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  51.92 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  46.3 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.86 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  53.06 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7126  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.83 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.98 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.98 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4234  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0811126  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  50.98 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 87 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.22 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  27.72 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>